Здравствуйте!
Решил поделиться своим опытом решения данной проблемы.
У меня Sony PRS-T1 тоже вопросительные знаки были при русском тексте книг.
Скачал программу "calibre - E-book management" (есть на русском) очень хорошая и полезная утилита, всем рекомендую, у кого еще не стоит. 
В эту программку закидываете книги в формате EPUB > Кликаете правой клавишей по книжке > Преобразовать книги > Индивидуальное преобразование. > в разделе "Вид и функции" выберете вкладку "Текст" > в маленьком окошке с названием Input character encoding (кодировка) выберете cp1251 и нажмите Ок. (Проверте чтобы в правом верхнем углу Формат вывода стоял EPUB). 
Дальше забрасываем эту книгу в свой электронный девайс. Нажимаем правой кнопкой миши > Отправить в устройство > Отправить в основную память.
Отсоединяемся от ПК, включаем електронную книжку, выбираем только что сделанную книгу. Открываем и видим что вместо текста все равно вопросительные знаки, не пугайтесь, Кликаем по клавише с настройками отображения текста > Font (или Шрифт у кого какая прошивка.) и в выпадающем списке выберете "Univers Next".
Всем приятного чтения.